Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DPM3Q9P2X0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DPM3Q9P2X0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms