Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GSKIPQ9P0R6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSKIPQ9P0R6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms