Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GDAP2Q9NXN4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms