Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PGPEP1Q9NXJ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms