Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INCENPQ9NQS7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms