Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASS4Q9NQ75 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms