Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NRIP3Q9NQ35 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms