Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBC1D2Q9BYX2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms