Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG6Q9BXT2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms