Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms