Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPATA16Q9BXB7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPATA16Q9BXB7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms