Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT61BQ9BVS5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT61BQ9BVS5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms