Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMSS1Q9BQ75 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms