Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RETNLBQ9BQ08 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms