Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYCBPQ99417 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYCBPQ99417 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms