Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CICQ96RK0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms