Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NSMCE2Q96MF7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NSMCE2Q96MF7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms