Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms