Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCARF2Q96GP6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms