Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MFSD3Q96ES6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFSD3Q96ES6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms