Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPACA9Q96E40 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms