Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAAF4Q8WXU2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms