Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX54Q8TDD1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms