Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms