Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NGDNQ8NEJ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms