Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC24Q8N4L8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC24Q8N4L8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms