Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL34Q8N239 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL34Q8N239 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms