Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS37DQ86XT2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS37DQ86XT2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms