Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms