Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BHLHA9Q7RTU4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms