Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q71RC1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q71RC1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q71RC1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q71RC1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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