Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DUX4L9Q6RFH8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms