Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3L3Q68CJ9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms