Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF20Q5VTR2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF20Q5VTR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms