Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
COL5A1-AS1Q5SY13 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms