Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PITRM1Q5JRX3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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