Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FREM1Q5H8C1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FREM1Q5H8C1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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