Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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