Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 3,571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SVEP1Q4LDE5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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SVEP1Q4LDE5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SVEP1Q4LDE5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SVEP1Q4LDE5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SVEP1Q4LDE5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SVEP1Q4LDE5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SVEP1Q4LDE5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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