Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KIAA1644Q3SXP7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KIAA1644Q3SXP7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms