Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROSER3Q2NL68 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROSER3Q2NL68 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms