Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ME3Q16798 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ME3Q16798 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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ME3Q16798 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME3Q16798 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ME3Q16798 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ME3Q16798 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms