Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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