Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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