Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACKR1Q16570 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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