Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEDD8Q15843 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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