Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC85BQ15834 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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