Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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