Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNHIT3Q15649 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms