Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1D2Q14995 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1D2Q14995 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1D2Q14995 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1D2Q14995 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms